邓明华教授擅长领域：计算和系统生物学。

主要完成项目：

基于蛋白质结构与相互作用的计算生物学研究（子课题：蛋白质相互作用网络形成的结构基础与动力学分析） 

基于探针杂交机制的生物芯片数据预处理统计方法研究 

蛋白质复杂网络构建与分析及其在肝癌疾病中的应用

构建基于生物学功能的跨物种转录组比较和进化研究的平台

转录因子结合位点(TSBS)研究

基因功能预测的生物信息学理论与应用(子课题三)

基因组注释系统的标准建立和软件开发

复杂系统的统计力学研究及在计算分子生物学中的应用

真核生物基因及其编码蛋白的信息基础